MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY05

Total Repeats: 635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009471	CCGC	2	8	528	535	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
2	NC_009471	GC	3	6	611	616	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
3	NC_009471	CG	3	6	643	648	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
4	NC_009471	CGC	2	6	681	686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
5	NC_009471	GCC	2	6	691	696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
6	NC_009471	GC	3	6	785	790	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
7	NC_009471	GC	3	6	807	812	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
8	NC_009471	CGG	2	6	842	847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
9	NC_009471	TCA	2	6	859	864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244089
10	NC_009471	GCC	2	6	865	870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
11	NC_009471	GCGG	2	8	888	895	0 %	0 %	75 %	25 %	148244089
12	NC_009471	GCG	2	6	900	905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
13	NC_009471	CCT	2	6	908	913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244089
14	NC_009471	GC	3	6	957	962	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
15	NC_009471	GCC	3	9	1025	1033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
16	NC_009471	CCGT	2	8	1120	1127	0 %	25 %	25 %	50 %	148244089
17	NC_009471	GCC	2	6	1137	1142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
18	NC_009471	GTG	2	6	1168	1173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244089
19	NC_009471	TGG	2	6	1190	1195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244089
20	NC_009471	CCGG	2	8	1224	1231	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
21	NC_009471	GCA	2	6	1289	1294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
22	NC_009471	GCC	2	6	1359	1364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
23	NC_009471	T	6	6	1403	1408	0 %	100 %	0 %	0 %	148244089
24	NC_009471	CCG	2	6	1457	1462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
25	NC_009471	CAG	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
26	NC_009471	TCGCC	2	10	1517	1526	0 %	20 %	20 %	60 %	148244089
27	NC_009471	CG	5	10	1530	1539	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
28	NC_009471	CCG	2	6	1599	1604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
29	NC_009471	GCG	2	6	1618	1623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
30	NC_009471	CG	3	6	1627	1632	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
31	NC_009471	CGA	2	6	1655	1660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
32	NC_009471	GCCGT	2	10	1666	1675	0 %	20 %	40 %	40 %	148244089
33	NC_009471	GCC	2	6	1716	1721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
34	NC_009471	GCA	2	6	1727	1732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
35	NC_009471	CG	3	6	1745	1750	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
36	NC_009471	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244089
37	NC_009471	TCGA	2	8	1837	1844	25 %	25 %	25 %	25 %	148244089
38	NC_009471	CCA	2	6	1871	1876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
39	NC_009471	CAC	2	6	1953	1958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
40	NC_009471	GCCG	2	8	1982	1989	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
41	NC_009471	TGA	2	6	2003	2008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244089
42	NC_009471	CGCC	2	8	2035	2042	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
43	NC_009471	CG	3	6	2081	2086	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
44	NC_009471	GCCA	2	8	2093	2100	25 %	0 %	25 %	50 %	148244089
45	NC_009471	CACGC	2	10	2132	2141	20 %	0 %	20 %	60 %	148244089
46	NC_009471	CCA	2	6	2144	2149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
47	NC_009471	TGCC	2	8	2171	2178	0 %	25 %	25 %	50 %	148244089
48	NC_009471	GCC	2	6	2182	2187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
49	NC_009471	GAT	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244089
50	NC_009471	ATC	2	6	2230	2235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244089
51	NC_009471	CGC	2	6	2280	2285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
52	NC_009471	GCCT	2	8	2334	2341	0 %	25 %	25 %	50 %	148244089
53	NC_009471	GCC	2	6	2344	2349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
54	NC_009471	GC	3	6	2360	2365	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
55	NC_009471	GC	3	6	2383	2388	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
56	NC_009471	GTC	2	6	2389	2394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244089
57	NC_009471	GAT	2	6	2457	2462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244089
58	NC_009471	GC	3	6	2469	2474	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
59	NC_009471	GCC	2	6	2487	2492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
60	NC_009471	CG	3	6	2516	2521	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
61	NC_009471	CGC	2	6	2552	2557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
62	NC_009471	GCCG	2	8	2568	2575	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
63	NC_009471	CTCGTC	2	12	2604	2615	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148244089
64	NC_009471	TGA	2	6	2618	2623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244089
65	NC_009471	CCGC	2	8	2624	2631	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
66	NC_009471	AGCCG	2	10	2683	2692	20 %	0 %	40 %	40 %	148244089
67	NC_009471	CCG	2	6	2708	2713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
68	NC_009471	TCC	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244089
69	NC_009471	GCC	2	6	2768	2773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
70	NC_009471	TCG	2	6	2794	2799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244089
71	NC_009471	GCC	2	6	2826	2831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
72	NC_009471	CAG	2	6	2835	2840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
73	NC_009471	GGC	2	6	2889	2894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
74	NC_009471	CGC	2	6	2940	2945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
75	NC_009471	TCC	2	6	2953	2958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244089
76	NC_009471	GCCGC	2	10	2972	2981	0 %	0 %	40 %	60 %	148244089
77	NC_009471	GGT	2	6	2985	2990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244089
78	NC_009471	CCG	2	6	3018	3023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
79	NC_009471	C	6	6	3056	3061	0 %	0 %	0 %	100 %	148244089
80	NC_009471	GCGG	2	8	3243	3250	0 %	0 %	75 %	25 %	148244089
81	NC_009471	GCC	2	6	3303	3308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
82	NC_009471	TCGG	2	8	3406	3413	0 %	25 %	50 %	25 %	148244089
83	NC_009471	GCGCC	2	10	3524	3533	0 %	0 %	40 %	60 %	148244089
84	NC_009471	CCGC	2	8	3536	3543	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
85	NC_009471	G	6	6	3635	3640	0 %	0 %	100 %	0 %	148244089
86	NC_009471	GGCG	2	8	3699	3706	0 %	0 %	75 %	25 %	148244089
87	NC_009471	GCC	3	9	3754	3762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
88	NC_009471	CCGC	2	8	3787	3794	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
89	NC_009471	GC	3	6	3793	3798	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
90	NC_009471	CGCCC	2	10	3825	3834	0 %	0 %	20 %	80 %	148244089
91	NC_009471	ACC	2	6	3862	3867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
92	NC_009471	GCC	3	9	3892	3900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
93	NC_009471	GGC	2	6	3947	3952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
94	NC_009471	CAG	2	6	3972	3977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
95	NC_009471	CCA	2	6	4016	4021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
96	NC_009471	CCG	2	6	4024	4029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
97	NC_009471	ACA	2	6	4042	4047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244089
98	NC_009471	CAC	2	6	4068	4073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
99	NC_009471	CCG	2	6	4136	4141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
100	NC_009471	CAG	2	6	4145	4150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244089
101	NC_009471	CGG	2	6	4189	4194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
102	NC_009471	CAC	2	6	4290	4295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244089
103	NC_009471	GCC	2	6	4306	4311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
104	NC_009471	CCG	2	6	4316	4321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
105	NC_009471	CGGA	2	8	4338	4345	25 %	0 %	50 %	25 %	148244089
106	NC_009471	TCA	2	6	4361	4366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244089
107	NC_009471	CG	3	6	4439	4444	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
108	NC_009471	GCC	2	6	4453	4458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
109	NC_009471	CGCCCG	2	12	4511	4522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
110	NC_009471	CG	4	8	4587	4594	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
111	NC_009471	GCC	2	6	4603	4608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
112	NC_009471	GCC	2	6	4646	4651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
113	NC_009471	CCGC	2	8	4668	4675	0 %	0 %	25 %	75 %	148244089
114	NC_009471	GGC	2	6	4683	4688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
115	NC_009471	GGT	2	6	4707	4712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244089
116	NC_009471	GCC	2	6	4773	4778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
117	NC_009471	CGG	2	6	4799	4804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
118	NC_009471	ATCG	2	8	4824	4831	25 %	25 %	25 %	25 %	148244089
119	NC_009471	CG	4	8	4830	4837	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
120	NC_009471	CTC	2	6	4851	4856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244089
121	NC_009471	GCC	2	6	4858	4863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
122	NC_009471	CGG	2	6	4872	4877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
123	NC_009471	GCC	2	6	4921	4926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
124	NC_009471	ATC	2	6	4941	4946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244089
125	NC_009471	CTT	2	6	4955	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244089
126	NC_009471	ATC	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244089
127	NC_009471	GCG	2	6	4994	4999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
128	NC_009471	GTGC	2	8	5009	5016	0 %	25 %	50 %	25 %	148244089
129	NC_009471	GCC	2	6	5032	5037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244089
130	NC_009471	CGG	2	6	5042	5047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
131	NC_009471	TCC	2	6	5065	5070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244089
132	NC_009471	GGC	2	6	5122	5127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
133	NC_009471	CGGC	2	8	5141	5148	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
134	NC_009471	CG	3	6	5196	5201	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
135	NC_009471	GCG	2	6	5243	5248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244089
136	NC_009471	CG	3	6	5253	5258	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
137	NC_009471	TCT	2	6	5279	5284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244089
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254	NC_009471	GCTTG	2	10	14429	14438	0 %	40 %	40 %	20 %	148244097
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260	NC_009471	CCAT	2	8	14954	14961	25 %	25 %	0 %	50 %	148244098
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264	NC_009471	CCA	2	6	15195	15200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244098
265	NC_009471	GTG	2	6	15203	15208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244098
266	NC_009471	T	7	7	15410	15416	0 %	100 %	0 %	0 %	148244099
267	NC_009471	CGG	2	6	15430	15435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244099
268	NC_009471	GAA	2	6	15438	15443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244099
269	NC_009471	CCGC	2	8	15548	15555	0 %	0 %	25 %	75 %	148244099
270	NC_009471	GCTGCC	2	12	15673	15684	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	148244099
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273	NC_009471	GCC	2	6	15719	15724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244099
274	NC_009471	CCAT	2	8	15752	15759	25 %	25 %	0 %	50 %	148244099
275	NC_009471	GGC	2	6	16060	16065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244100
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277	NC_009471	GC	4	8	16140	16147	0 %	0 %	50 %	50 %	148244100
278	NC_009471	CGCAC	2	10	16155	16164	20 %	0 %	20 %	60 %	148244100
279	NC_009471	GTT	2	6	16172	16177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	148244100
280	NC_009471	CGC	2	6	16224	16229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244100
281	NC_009471	GCT	2	6	16314	16319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244100
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288	NC_009471	GCT	2	6	16444	16449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244101
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291	NC_009471	CCG	2	6	16603	16608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244101
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293	NC_009471	GCG	2	6	16992	16997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244102
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295	NC_009471	GC	3	6	17044	17049	0 %	0 %	50 %	50 %	148244102
296	NC_009471	GCA	3	9	17084	17092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244102
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299	NC_009471	TGCG	2	8	17149	17156	0 %	25 %	50 %	25 %	148244102
300	NC_009471	TGC	2	6	17176	17181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244102
301	NC_009471	CTC	2	6	17194	17199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244102
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392	NC_009471	TCCC	2	8	23292	23299	0 %	25 %	0 %	75 %	148244106
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394	NC_009471	AG	3	6	23339	23344	50 %	0 %	50 %	0 %	148244106
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399	NC_009471	CCTG	2	8	23498	23505	0 %	25 %	25 %	50 %	148244106
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483	NC_009471	AT	4	8	28313	28320	50 %	50 %	0 %	0 %	148244108
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495	NC_009471	CCG	2	6	28997	29002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244109
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500	NC_009471	GC	3	6	29278	29283	0 %	0 %	50 %	50 %	148244109

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